FASTA
| FASTA | |
|---|---|
| Repozitoriya | github.com/wrpearson/fas… |
| Proqramlaşdırma dili | C |
| Əməliyyat sistemi | Unix bənzəri, Linux, Microsoft Windows, macOS |
| Sonuncu versiya | |
FASTA — Bioinformatika sahəsində geniş istifadə olunan bir format və alqoritm.[3]
O, əsasən DNT, RNT və zülal ardıcıllıqlarının saxlanması, emalı və müqayisəsi üçün tətbiq olunur. Bu format, sadə və oxunaqlı olduğu üçün müxtəlif bioinformatik proqramlarda və VB-də geniş istifadə edilir.[4] FASTA həmçinin eyni adlı ardıcıllıq müqayisə alqoritminin adıdır. Bu alqoritm, biomolekulyar ardıcıllıqlar arasında oxşarlıq tapmaq üçün istifadə olunur və BLAST kimi daha inkişaf etmiş metodların əsasını təşkil edir.
İstinadlar
[redaktə | vikimətni redaktə et]- ↑ http://faculty.virginia.edu/wrpearson/fasta/changes_v36.html.
- ↑ Release 36.3.8d. 2016.
- ↑ Lipman, DJ; Pearson, WR. "Rapid and sensitive protein similarity searches". Science. 227 (4693). 1985: 1435–41. Bibcode:1985Sci...227.1435L. doi:10.1126/science.2983426. PMID 2983426.
- ↑ Pearson, WR; Lipman, DJ. "Improved tools for biological sequence comparison". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 85 (8). 1988: 2444–8. Bibcode:1988PNAS...85.2444P. doi:10.1073/pnas.85.8.2444. PMC 280013. PMID 3162770.
